این دستورالعمل به منظور جلب و جذب سرمایه‌گذاری داخلی و خارجی و توسعه مزیت رقابتی، سازمان‌های مناطق مجازند در چارچوب قوانین و مقررات اختصاصی خود، نسبت به اعمال مشوق‌ها جهت توسعه سرمایه‌گذاری، تولید، صادرات، افزایش نفوذ فناوری و نوآوری، حمایت از شتاب‌دهنده‌ها در 7 ماده و 34 بند و 3 تبصره به تأیید دبیر شورای‌عالی مناطق آزاد و ویژه اقتصادی رسیده است.

در این دستورالعمل مشوق‌های توسعه سرمایه گذاری و بهبود محیط کسب و کار، افزایش نفوذ نوآوری و فناوری و حمایت از شتاب دهنده‌ها، و توسعه صادرات مورد توجه قرار گرفته است.