محورها و برنامه های پیش رو در این تفاهم نامه شامل گمانه‌زنی و کاوش‌های باستان‌شناسی در محوطه‌های تاریخی - فرهنگی و زیر آب منطقه، شناسایی و معرفی پتانسیل‌های بناهای تاریخی جزیره کیش، شناسایی و معرفی پتانسیل‌های بناهای تاریخی کیش، تعیین عرصه و حریم آثار ثبتی و حفاظتی کیش با همکاری طرفین می باشد.

همچنین بررسی و پژوهش معماری و بافت بومی منطقه، برنامه‌ریزی در راستای حفاظت، مرمت و بهره‌برداری بهینه از بناهای تاریخی جزیره کیش، مستندنگاری و پژوهش‌های مردم‌شناسی و زبانشناسی با هدف بهره‌برداری و ثبت در اطلس مربوطه، ضبط، سیاهه‌برداری، مستندسازی و پژوهش میراث ناملموس محلی جزیره، ظرفیت‌سازی منطقه آزاد کیش در راستای حفاظت و بهره‌برداری بهینه از میراث گران‌سنگ فرهنگی و طبیعی از دیگر برنامه های پیش بینی شده در این تفاهم نامه است.